Análise de Metilação em Tumores Esofágicos, Tecido Não Maligno

Dec 03, 2023

Domínios parcialmente metilados específicos do tipo celular e domínios diferencialmente metilados encontrados em células normais persistem em células malignas, relatam pesquisadores do Cedars-Sinai Medical Center em Los Angeles e em outros lugares na Genome Biology. Eles analisaram os perfis de sequenciamento de bissulfito do genoma completo de 45 tumores esofágicos, representando os subtipos de carcinoma de células escamosas e adenocarcinoma, e tecidos não malignos correspondentes. Usando um chamador PMD multimodelo com reconhecimento de sequência que eles desenvolveram, denominado MMSeekR, os pesquisadores descobriram um alto nível de heterogeneidade no nível de metilação e na distribuição de PMDs em amostras de tumores. Onde esses PMDs caem no genoma estão presentes em células normais, eles relatam, mas observam que as células tumorais exibem um nível mais alto de perda, e acrescentam ainda que a deposição de H3K36me2 específica do tipo de célula pode moldar como os PMDs são distribuídos por todo o genoma. Entretanto, ao nível do DMR, os investigadores encontraram mais de 10.000 hipo-DMRs entre os dois tipos de cancro do esófago e também observaram que muitas das alterações de metilação também estavam presentes nas células normais. “Até onde sabemos, esta é a primeira demonstração da proeminente especificidade do tipo celular dos PMDs em estados normais, precursores e malignos”, escrevem os pesquisadores.